Основные научные направления секции: структурная биология, физико-химическая биология, биотехнология, биоорганическая химия, нейробиология, нанобиотехнология.
Формат проведения: онлайн
Рабочий язык: русский, возможно представление доклада на английском языке.
Дата проведения: 03 апреля 2023г. в 10:00 часов
Cellular components can form structures without membranes. such as nucleoli, can be aggregates of proteins, nucleic acids, or both, are called membrane-less organelles. A recent area of study explains the plasticity of biological molecules of internally disordered proteins, which lack a fixed spatial structure.The nine hallmarks of aging, which were shown defined some limitation and needed further expansion. we propose that PMLOs integerity is a hallmark of aging.
На основе литературных данных сконструированы панели вариантов Ngb и Cyt с с заменами аминокислотных остатков в предполагаемом интерфейсе их взаимодействия. Методом сайт-направленного мутагенеза мутации вносили в гены Ngb и Cyt с в составе плазмидных векторов. Мутантные варианты Ngb и Cyt с получали с использованием экспрессионных систем, разработанных в нашей лаборатории для белков дикого типа, с небольшими модификациями для отдельных мутантов.
Разработка новых способов детекции клеточной гибели играет важную роль в фундаментальных исследованиях. В последнее время популярность получили электрохимические методы определения апоптоза. В литературе был предложен метод детекции апоптоза, основанный на взаимодействии фосфатидилсерина и ионов меди. В данной работе показано использование данного подхода для детекции клеточной гибели эритроцитов, вызванной окислительным стрессом, с помощью метода циклической вольтамперометрии.
Объектом наших исследований является тетранитрозильный комплекс железа с тиосульфатными лигандами (ТНКЖ), относящийся к классу перспективных экзогенных доноров молекулы NO. В данной работе было рассмотрено взаимодействие ТНКЖ с двумя формами гемоглобина. Установлено, что в присутствии гемоглобина комплекс медленнее донирует NO, что свидетельствует о его стабилизации на поверхности белка.
One of the promising approaches in the cancer treatment is the development of novel drugs able to inhibit the TGF-β activation to prevent epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and tumor metastasis. In the current research, we encapsulated the TGF-β inhibitors into alginate gel to realize local drug delivery strategy and demonstrated the efficacy of this approach in vitro.
В данной работе проводилось исследование влияния ортофосфатов церия, перспективных в качестве фотопротекторов, на клеточную линию мышиной меланомы B16/F10.
В рамках исследования была разработана технология получения аденоассоциированных(AAV) вирусных частиц от лабораторного до предпромышленного масштабов. Подобраны оптимальные параметры для культивирования, трансфекции, лизиса и фильтрации клеточной культуры.
Технология малых интерферирующих РНК открывает большие перспективы для лечения различных заболеваний человека путем направленного снижения уровня активности генов. Некоторые терапевтические средства, основанные на принципе РНК-интерференции, уже одобрены для клинического применения и доступны на коммерческой основе. Например, препарат Patisiran для лечения наследственного транстиреин-опосредованного амилоидоза.
Наночастицы являются перспективным средством тераностики. Одним из препятствий для их применения в медицине является недостаток способов доставки наноматериалов в ткани и к органам непосредственно. Нами разработан новый способ доставки наночастиц с применением изолированных митохондрий. Использование митохондрий обусловлено их естественным присутствием в кровотоке млекопитающих и отсутствием имунного ответа.
Получена новая информация о структуре и взаимодействиях Trk-рецепторов, без которых невозможны нормальное развитие и функционирование нервной системы.
Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) – грамположительная, аэробная, подвижная бактерия, вызывающая ржаво-бурую пятнистость листьев сои и фасоли. Представленная работа сфокусирована на изучении возможности использования бактериофагов и фаговых литических белков для борьбы с ржаво-бурой пятнистостью.
Биоимиджинг является одним из самых быстро эволюционирующих методов изучения мембранных белков. В нашей работе методами флуорецентного имиджинга мы исследовали влияние нескольких производных 5-алкокси-1-арил-3-полифлуороалкилпиразолов и пептида HCRG21 на ноцицептивный рецептор TRPV1. В результате мы смогли сравнить эффективность кальций-чувствительного красителя Fluo4 и потенциал-чувствительного красителя R8126 и отобрать новые агонисты и антагонисты TRPV1 из ряда исследованных молекул.
В данной работе методами ЯМР-спектроскопии была определена пространственная структура комплекса каротиноид-связывающего белка AstaP с молекулой астаксантина.
В работе описана разработка системы очистки и стабилизации α7-nAChR из клеток HEK293F и дальнейшее исследование полученного препарата с помощью криоэлектронной микроскопии в комплексе с лигандами и без.
In this work, we evaluate the antimicrobial properties of free fatty acids extracted from Black Soldier Fly larvae fat. GC-MS was used to establish the constituents of the extracts. Lastly, we used molecular docking to predict the protein targets of these antimicrobial fatty acids.
Наночастицы металлов представляют особый интерес для онкотераностики в связи с их уникальными физико-химическими свойствами. В данной работе проведён подбор условий для синтеза сферических наночастиц серебра с контролируемым размером.
Предложены новые тест-системы для полевого определения общего содержания серы, сульфат ионов, карбонат и гидрокарбонат ионов, а также ортофосфат ионов в пробах пресной природной воды. Отличительной особенностью данных тест-систем является возможность их применения пользователями, не имеющих квалификации химика-аналитика. Описанные в работе тест-системы предполагается внедрять в портативные комплексы экспресс-анализа пресных природных вод, как их неотъемлемую часть.
В данной работе были получены наночастицы магнетита для механо-индуцированного уничтожения HER2-положительных опухолей при воздействии низкочастотного магнитного поля.
В данной работе мы разработали двухстадийную систему адресной доставки, основанной на белковом интерфейсе, к HER2-положительным раковым клеткам.
Трехпетельные белки способны модулировать работу никотиновых ацетилхолиновых рецепторов, что делает их перспективными моделями для разработки лекарств для лечения нервной системы. В морской здвезде Asterias rubens нами был обнаружен белок Lystar5, являющийся гомологом нейромодулятора человека Lynx2. В данной работе была получена пространственная структура Lystar5 с помощью ЯМР-спектроскопии и исследована его фармакология.
Исследовано влияние остатка рибитола на спектры комбинационного рассеяния и гигантского комбинационного рассеяния рибофлавина и его производных (флавинмононуклеотида и люмихрома). Найдены спектральные отличия между данными веществами, в том числе и в пиках, отвечающих за колебания в кольцах, которые объясняются смещением электронной плотности.
В работе проведено структурно-функциональное исследование неклассического педиоцин-подобныого бактериоцина ацидоцина А. Нами получены его укороченные рекомбинантные аналоги, а также его гибриды с авицином А, классическим представителем педиоцин-подобных бактериоцинов, определена их антимикробная и мембранотропная активность. Показано, что разные участки цепи вносят приблизительно равный вклад в уровень активности ацидоцина А.
Была исследована зависимость глубины проникновения в опухоль магнитных наночастиц от различных полимерных покрытий ex vivo с помощью оптической микроскопии, а также найдены оптимальные с этой точки зрения покрытия
Multinucleated Giant Cancer Cells (MGCCs) has long been disregarded in the biology of cancer as an important player in the development of malegnancies and thier resistent to treatment. Here we studied the progenies of such cells and found a link between the senescence of their non-MGCC descendants and the ability to repopulate Non-Small Cell Lung Cancers in vitro.
Разработано открытое программное обеспечение, позволяющее проводить автоматизированный анализ записей синаптических токов. Разработанная программа использует современные алгоритмы анализа, рассчитывает оптимальное число параметров без потери физиологически значимой информации за сравнительно короткое время.
В данной работе были синтезированы магнитно-полимерные наночастицы для диагностики и фотодинамической терапии HER2-положительных опухолей.
В данной работе исследовано влияние токсиканта органического происхождения — метафоса на количественные изменения метаболизма, в частности на активность кислой фосфатазы
В данной работе был исследован антиоксидантный потенциал тетранитрозильного комплекса железа с пеницилламиновыми лигандами (соединение I) - донора монооксида азота (NO) на мышах с моделью кардиотоксичности, вызванной азитромицином. Показано, что введение соединения I в дозе 18 мг/кг мышам с моделью кардиотоксичности уменьшает интенсивность процесса перекисного окисления липидов, предотвращая развитие окислительного стресса.
Одним из основных направлений современной медицицны являются наночастицы (НЧ).Однако, попадая в организм наноагенты подвергаются распознованию и поглощению клетками системы мононуклеарных фагоцитов (СМФ).В данной работе исследовалась липосомальная блокада СМФ для улучшения фармакокинетики полимерных наночастиц.
За последние несколько лет достигнут значительный прогресс в разработке различных методов клеточной терапии. Основная проблема в количественном увеличении выращенной культуры связана с адгезивными клетками. В данной работе были разработаны микросубстраты, состоящие из нановолокон, на которые будет высеиваться клеточная культура. Основным преимуществом является возможность доставки клеточной культуры в прикрепленном виде к поврежденным участкам для использования в клеточной терапии.
Для проведения биомедицинских исследований широкое применение нашли нанокристаллы с антистоксовой флуоресценцией (НАФ), способные к преобразованию излучения дальней ИК-области в УФ- и видимый свет. Однако гидрофобный характер поверхности частиц требует ее модификации для создания биосовместимых реагентов. Были разработаны методы модификации НАФ гиалуроновой кислотой, для которой характерна высокая биосовместимость, и изучена степень сорбции белков крови на поверхности модифицированных НАФ.
В данной работе было показано, что дефенсин из цветков табака Nad1, полученный биотехнологическим способом путем гетерологичной экспрессии, обладает противогрибковой активностью против резистентных штаммов C. аlbicans, характеризуется фунгицидным действием и работает в синергизме с препаратом группы эхинокандинов – каспофунгином.
В данной работе проводилось исследование противовирусной активности производных фторхинолона в отношении SARS-CoV-2.
The aim of this study was to obtain composite nanostructures MOFs/metal-based nanoparticles for application in nanomedicine. We present physico-chemical characterization of the obtained sructures and their drug loading capacity for oncotheraputic drug doxorubicin.
В настоящее время растет усточивость бактерий к классическим противомикробным препаратам, вследствие чего появилась необходимость в разработке альтернативных и/или новых подходов к лечению. Наночастицы с антистоксовой флуоресценцией (НАФ) за счет своих особых свойств могут лечь в основу создания методов лечения в данной сфере.
В работе предлагается получение наноструктур на основе НАФ, которые будут иметь термочувствительные, флуоресцентные и противомикробные свойства.
В данной работе исследовалась роль липидного состава мембраны в ее спонтанной тубуляции под действием амфифильного пептида H0 ENTH домена белка эпсина, а также произвольных пептидов с аналогичным полярным/гидрофобным профилем. В качестве модели механически не натянутой мембраны использовали гигантские суспендированные бислои, во внешний объем которых добавляли пептид. Наблюдение за формированием мембранных нанотрубок, а также измерение их радиуса проводилось с помощью конфокальной микроскопии.
Перспективной альтернативой антибиотикам является антимикробная фотодинамическая терапия, основанная на генерации активных форм кислорода при облучении фотосенсибилизатора. Эффективность действия АФК увеличивается в случае использования в виде гибридных органо-неорганических наночастиц на основе металлов и оксидов металлов. Создание комплексов наночастиц серебра с флавимононуклеотидом, а также исследование механизма их действия является актуальной задачей.
Экспериментально исследована возможность разрушения тромбов на частицы размером менее 10 мкм при помощи низкочастотного ультразвука. Подобран фантом тромба.
Результаты свидетельствуют о возрастании числа частиц необходимого размера в течение времени воздействия ультразвуком с частотой 24 кГц и амплитудой волны 50 мкм, что позволяет избежать закупорки сосудов частицами, полученными в результате разрушения тромботических масс при использовании метода.
В данной работе представлен аппаратный метод одновременного контролируемого оптического облучения различных областей микропрепаратов. Одновременное освещение областей образца позволяет изучать взаимодействие разнообразных биологических объектов с оптическим излучением и дает доступ к исследованиям быстропротекающих процессов.
В настойщей работе приведены результаты исследования NO-донорной и ФДЭ ингибирующей активности двух перспективных представителей класса нитрозильных комлпексов железа: биядерный анионный комплекс 1 с тиосульфатными лигандами и моноядерный катионный комплекс 2 с тиомочевинными лигандами.
В данной работе впервые показан вариант реализации технологии ДНК-«наномаяка» - чувствительного к ультракоротким ДНК умного материала, на твердой сенсорной поверхности в проточном формате с помощью интерферометрического биосенсора. Предложенный сенсор прогнозируемо позволит увеличить чувствительность системы и измерить кинетические параметры взаимодействия с меткой, что позволит в будущем улучшить аналитические характеристики систем детекции, основанных на «наномаяках».
Термостабильные гликозил-гидролазы семейства GH12 часто применяются в качестве кормовых добавок. В данной работе идентифицирован аминокислотный остаток, ответственный за термостабильность эндоглюканазы Egh12 из Thielavia terrestris. Сконструирован мутантный вариант ксилоглюканазы Xgh12B из Aspergillus cervinus с повышенной термостабильностью.
В работе рассматривается разработка и применение хромато-масс-спектрометрической методики количественного определения стимулятора ЦНС 2-фенилэтиламина в темном шоколаде. Описывается подбор и оптимизация аналитических условий, процесс валидации, результаты анализа 26 коммерчески доступных на рынке РФ образцов темного шоколада
В данной работе изложены результаты экспериментов по созданию системы split-TurboID на основе биотин-лигазы для изучения и поиска возможных партнеров убиквитиновых цепей различного типа строения. На данный момент создано несколько вариантов сплит-системы с различной степенью эффективности и специфичности, а также методами масс-спектрометрии проанализирован пул биотинилированных белков в системе, содержащей убиквитины дикого типа, образующие все возможные типы цепей.
Практически каждая живая клетка содержит полиамины в миллимолярных концентрациях, они участвуют в важнейших клеточных процессах. В этой работе продемонстрировано увеличение активности 20S протеасомы вызванное спермином in vitro. Также нами было выявлено накопление 20S протеасом в клетках линий MCF7 и SH-SY5Y при обработке спермином.
Актуальной задачей тканевой инженерии является создание биосовместимых гидрогелевых скаффолдов. Одно из решений этого вопроса связано с разработкой новых композиций и методов получения гидрогелевых конструкций с помощью реакции фотоиндуцируемой сшивки. В данной работе для получения полимера, способного к фотоиндуцируемой сшивке, был использован способ химической модификации ГК глицидилметакрилатом для введения двойных связей, способных вступать в радикальную реакцию под действием света
В работе методом люминесцентных зондов исследовано взаимодействие нитрозильного комплекса железа (НКЖ) с липосомами. Определены константы Штерна-Фольмера в структуре липосом. Действие НКЖ на перекисное окисление липидов (ПОЛ) изучали спектрофотометрическим методом определения содержания малонового диальдегида при спонтанном ПОЛ и методом люминол-зависимой хемилюминесценции при инициированном ПОЛ. Мембранотропные свойства НКЖ коррелируют с их способностью влиять на процесс ПОЛ.
Данное исследование было проведено с целью наблюдения динамики параметров культивирования микроводоросли Chlorella vulgaris на надосадках после культивирования с использованием в качестве добавок к питательной среде вытяжки из урбиквазизема березняка.
По полученным данным можно сделать вывод, что продуктивность культуры, выращенной на надосадчной жидкости, превышала продуктивности контрольных образцов.
В данной работе мы продемонстрировали преимущество использования двухстадийной адресной доставки наночастиц на основе пары барназа*барстар по сравнению с одностадийной адресной доставкой для лечения и терапии раковых заболеваний in vitro и in vivo.
Пожилой возраст является одним из факторов риска развития болезни Альцгеймера, в связи с этим было выдвинуто предположение о наличии корреляции между накоплением фосфорилированного амилоида в ткани мозга и возрастом. В качестве объекта исследования были выбраны трансгенные мыши 5xFAD. В результате проделанной работы с использованием вестерн-блота и масс-спектрометрического анализа произведена оценка содержания p-Ser-8-Aβ в ткани мозга трансгенных мышей различного возраста.
В работе было проведено укорачивание нуклеотидной последовательности аптамера Gli-55, который специфично связывается с клетками глиобластомы. Сначала была установлена наиболее вероятная конформация аптамера в растворе, на основе данных МУРР и методов молекулярного моделирования. Затем на основе полученой структуры, бала проведена обрезка до 35 нт. Методом проточной цитометрии было установлено, что аптамер Gli-35 показал такое же связывание с клетками по сравнению с аптамером Gli-55.
На данный момент нами получены референсные ультраструктурные данные о компонентах астроцитарных сетей мозга здоровых мышей, которые в дальнейшем послужат основой для характеризации астроцитарных сетей при патологии.
В данной работе создан метод синтеза липидных наночастиц с высокой степенью монодисперсности. Показано что полученные этим методом наночастицы способны инкапсулировать различные модельные олигонуклеотиды и мРНК. Благодаря простоте применения и высокому качеству получаемых ЛНЧ разработанный метод может найти широкое практическое применение.
